三級生物反應器是一種準確控制和操控微尺度流體，以在微納米尺度空間中對流體進行操控為主要特征的科學技術，具有將生物、化學等實驗室的基本功能諸如樣品制備、反應、分離和檢測等縮微到一個幾平方厘米芯片上的能力，其基本特征和較大優勢是多種單元技術在整體可控的微小平臺上靈活組合、規模集成。是一個涉及了工程學、物理學、化學、微加工和生物工程等領域的交叉學科。
三級生物反應器的部件及其功能：
傳統設計是由石頭或木材制成的開放式圓形或矩形容器。
大多數發酵都是在封閉系統中進行的，以防止污染。
它應由無毒和耐腐蝕的材料制成。
容量僅為幾升的小型發酵罐由玻璃或不銹鋼制成。
中試秤和各種生產容器均由不銹鋼制成，內表面經過拋光處理。
大型發酵罐通常由低碳鋼制成，然后襯有塑料或玻璃以降低成本。
如果需要無菌工藝，運輸接種物、空氣和發酵原料的管道必須進行滅菌，通常用蒸汽消毒。
現在，大多數容器清潔過程都通過噴頭實現自動化，被稱為原位清洗。
管道的設計須限制微生物污染的機會。水平方向上不應該有接縫，也不應該有任何不必要的管道和停滯空間，這些空間是物質可以聚集的死的；否則，結果可能是無效的滅菌。
通常，發酵罐配備外套。較大的容器帶有內部線圈。
應使用安全和壓力表閥門（在滅菌和操作期間需要）。
為了輸送介質，使用了離心泵磁耦合射流和蠕動泵。
液體輸送的替代方法包括重力進料或容器壓力。
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