厭氧生物反應器的工作愿理是利用厭氧細菌群體：將含有有機物質的廢氣或廢水氧化為無機物質，從而實現凈化效果。厭氧細菌是一種不需要氧氣而可以進行代謝活動的細菌，它能夠利用氧化還原反應將有機物氧化成無機物，如CO2，氨氮，硝酸鹽等。因此，厭氧反應器往往設置在廢氣或廢水處理設備的末端，來凈化廢氣或廢水中的有機物質。
 

　　厭氧生物反應器使用須注意：

 

　　1、厭氧反應器在投入之前，必須進行充水試驗和密性試驗。充水試驗要求漏水現象，密性試驗要求池內加壓到350mm水柱，穩定15min后壓力降小于100 mm水柱。而且在進行厭氧污泥的培養和馴化之前，應使氮吹掃。
 

　　2、厭氧活性污泥應從處理同類污水的正在的厭氧處理構筑物中取得，也可取自江河湖泊沼澤底部、市政下水道及污水集積處等處于厭氧環境下的淤泥，甚至還可以使用好氧活性污泥法的剩余污泥進行轉性培養，但這樣做需要的時間要更長的一些。
 

　　3、厭氧反應器因為微生物增殖緩慢，一般需要的啟運時間較長，如果能接種大量的厭氧污泥，可以縮短啟動時間。一般接種污泥的數量要達到反應器容積的10% ~9%，具保值根據接種污泥的來源情況而定。接種量越大，啟動時間越短，如果接種污泥中含大量的甲烷菌，效果會更好。